такого не должно быть, т.к. перезагрузка никак не влияет на точки. они рассчитываются раз и навсегда. другое дело, если пересчитать все контрольные точки заново (например после добавления новых закладок вы это сделали, или после добавления каких либо примитивов карт), то ВСЕ точки базы помечаются как неконтрольные, происходит пересчет по закладкам/примитивам. и вот все что не рассчиталось как контрольные, станут неконтрольными. и соответственно если начать пересчет по справочнику населенных пунктов всех неконтрольных, то они будут рассчитываться заново.

выбор “все” или “только выделенные” относится к закладкам. т.е. в расчете будут учавствовать либо все закладки, либо только те, что помечены галочками. а вот выбор “все точки” или “точки за последние х суток” позволяет указать – всю ли базу сообщений от объектов пересчитывать, или только за определенный интервал времени.